当组织建立体系时，还需着重注意以下四个问题。
一、 体系应结合组织现有的管理基础
一般组织在职业健康安全管理上，都存在着原的组织机构、管理制度、资源等。而按GB/T 28001建立的体系，实际上是组织实施职业健康安全管理，改善组织的职业健康安全行为，达到持续改进目的的一种新的运行机制。它不能完全脱离组织原有管理基础，而是在GB/T 28001的框架内，充分结合组织的原有管理基础，进而形成一个结构化的管理体系。
二、 体系是一个动态发展、不断改进和不断完善的过程
体系的运行，是依据GB/T 28001中要素所规定的职业健康安全方针、政策、实施和运行、检查和纠正措施及管理评审等环节实施，并随着科学技术的进步，法规的完善，客观情况的变化以及人们职业健康安全意识的提高，自身会不断地改进、补充和完善并呈现螺旋式上升。每经过一个循环过程，就需要制定新的职业健康安全目标和新的实施方案，调整相关要素的功能，使原有的体系不断完善，达到一个新的运行状态。
三、 体系应充分反映组织的特点
组织的体系结构的支持及建立和运行所需投入的资源，都会因组织的规模、性质等条件不同而有较大的差异。组织要根据GB/T 28001所提供的结构框架，结合自身的特点来建立和运行体系。尤其对于中、小型企业，建立体系时更要结合企业的具体情况来实施标准的要求，做到切实可行。注意即使规模、性质相类似的企业在建立体系时也不能相互机械照搬。
四、 与其他管理体系的结合
现在许多组织按照GB/T 19001建立了质量管理体系，按照GB/T 24001建立了环境管理体系。职业健康安全与质量、环境管理体系遵循着共同的系统化管理原则。特别是GB/T 28001与GB/T 24001具有相同的运行结构模式。所以，已建立质量和环境管理体系的组织，在建立职业健康安全管理体系时，可以借鉴建立质量和环境管理体系的思路。此外，还要注意三个体系内容的相互结合，特别是环境管理体系和职业健康安全管理体系在内容上有更多交叉，要注意二者的结合，不要出现矛盾和职责不清的现象。现在有的组织将三个体系融合到一起，搞管理体系一体化，使三个体系紧密地结合到一起。
1/9/2005
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